测序深度为什么检测的都不一样

Ⅰ 二代测序影响某一个样品深度的原因

二代测序影响某一个样品深度的原因：由于单分子测序具有通量更高，仪器和试剂相对便宜、操作简单等的优势而比第二代测序技术有更广阔的应用空间。

在二代测序中，为了有效覆盖全基因组，获得的数据量一般是被测基因组的几十倍，然后再拼接。
也就是说，理论上，每个位点都要被覆盖几十次甚至上百次，这个次数就叫测序深度，所以，二代测序也成为深度测序。

基因组测序

由于具有读长长的特点，SMRT测序平台在基因组测序中能降低测序后的Contig数量，明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量，节省大量的时间。Christophern等仅仅用0.5×的PacBioRS系统长度的数据与38×的二代测序(NGS)的测序数据，对马达加斯加的一种指猴基因组进行拼装，大幅度提高了数据的质量和完整度。

Ⅱ 为什么高通量测序dna是深度，rna测序是多少m

由于RNA表达的时空和时间的特异性，所以不同时刻或者是同一时刻不同组织内RNA表达的数目有着较大的差别，所以我们在说RNA的测序数据量时就不能够用测序深度来表示。一般在说RNA测序时会说我们测了多少的cluster, 就是打断后的RNA分子。比如说某一个RNA样本测序用了30M(30million)的cluster,采用双端测序技术，就是每个cluster从两端都测一次，每次测150bp,所以就会得到30M*2=60M的reads数，然后reads数乘以每条read的长度就是我们最后的测序数据量（碱基数），即为60M*150=9G的碱基数。

Ⅲ 我做了两次基因检测为什么结果不一样

同一个人检查方法不同，标准值不同。很容易产生误差.即使是在同一医院,同一个化验员化验,不同时间抽的血,化验出来的结果也不可能完全一致。

做基因检测是一定要选择正规的，有一定规模的机构，尽量不要选择小公司，小公司很多设备不够先进，检测深度和检测广度是不足的，检测质量无法保证，如果只是依靠小公司检测结果确定治疗方案，很容易错过好的治疗机会。还有一个是实时性，主流的公司解读报告是能做到与时俱进，将最新的指南建议和临床发现及时更新在用药建议里，小公司我连检测方案的选择还是依据的是2011年的NCCN指南建议。而且小公司因为技术水平达不到，在检测仪和各种试剂上的定价都很容易受上游控制，而主流机构的检测仪和试剂都是自己研发的，所以定价会合理很多。

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Ⅳ 测序深度的深度指的是什么

测序深度（Sequencing Depth）：测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小（Genome）的比值，它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系，测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。重测序的个体，如果采用的是双末端或Mate-Pair方案，当测序深度在10~15X以上时，基因组覆盖度和测序错误率控制均得以保证。

Ⅳ 测序完成后怎样检测测序结果的准确性

1、看测序质量：Q20、N多不多。
2、GC含量是否分离，与基因组相比较是不是差距较大。
3、如果有基因组的话，和基因组比对一下，看比对效率高不高。
4、如果测序测的深度够深的话，一般不用检查，单条序列的准确性低对后续分析影响不大。

Ⅵ 为什么不同基因测序公司提供的分析结果大相径庭

首先，他们选择的SNP位点可能来自于不同研究报告的结论，这些结论有的经过反复的检验，形成了金标准，但是还有一些并没有那么的靠谱；其次他们采用的检测技术和分析方案各有不同，同一个SNP位点的同一种状态，根据不同的分析方法也许就会出现不同的概率；最后他们在给出报告的时候，对人种、生活方式、环境因素的考量方式不同，也就会出现不同的概率。

3. 通过采集母体血液进行胎儿染色体异常疾病（如唐氏综合症）无创筛查，准确率已经达到羊水穿刺等传统方法相同的水平。

Ⅶ solexa测序时的测序深度和覆盖度是怎么理解，怎么区别的

测序深度可以理解为对一段序列上的区域重复检测的次数，比如一个序列被上某个片段被检测了30次就是30x，深度越大，越准确，覆盖度就是对你的目的基因所覆盖的程度，比如你的序列是有30bp但是由于测序的时候某些区域没有测到，只测到了27bp大小片段，那就是27/30等于90%

Ⅷ RNA是测序深度为什么

基因组测序的测序深度一般是10x。
测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2m，测序深度为10x，那么获得的总数据量为20m。
基因测序是一种新型基因检测技术，能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理，如癌症或白血病，运动天赋，酒量等。

Ⅸ 测序深度

测序得到的碱基总数就是原始的测序数据，其中会包括一些低质量的碱基，通过去除低质量的碱基，再去除片段过短的序列，得到高质量的序列用于后续分析。一般评价测序深度都是用过滤之后高质量的序列来进行评估的，这些序列也将参与后续的分析。

Ⅹ 二代测序为什么有的用G有的用reads代表测序深度

二代测序中G就是Gb跟硬盘的Gb一样，因为数据量非常大，所以一般都用多少G来生命测序得到的碱基数据。reads是指读出的短序列、短片段。测序深度一般用数字加乘号来表示比如100X这样。表示测序实际得到的有效碱基数据比模板实际碱基数据。

二代测序技术可以帮助发现新的治疗靶点，可以是新基因上的新靶点，也可以是已知基因上的耐药靶点；还可以帮助患者选择更好的治疗方式，这在靶向治疗和免疫治疗时代显得尤为重要；最后它还可以帮助预测癌症的复发，以及筛查早期癌症。

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